Le Missouri Fox Trotter, comme son nom l’indique, est originaire des Etats-Unis. Il est issu de Pur-sang, de Morgans et d’Arabes appartenant aux colons Américains. Ces derniers ont développé la race au début du XIXe siècle pour produire une race confortable, solide, rapide et capable de les transporter sur tous les terrains. Ultérieurement, des croisements avec des Saddleberd et des Tennessee Walking Horses furent effectués améliorer la race et pour obtenir le « fox trot», une allure qui lui est propre. Le stud-book de cette race a été ouvert à partir de 1948.

Le Missouri Fox Trotter est calme et coopératif, comme de nombreux chevaux d'équitation. Cependant, Il se montre aussi énergique et courageux. Il est apprécié des cow-boys.