Le cheval Comtois est apparu au VIème siècle dans dans les montagnes du Jura. Il résulte du croisement entre des juments de races locales et des étalons germaniques. Il est connu comme ayant été un excellent cheval de guerre. En effet, il a participé à de nombreux combats sous le règne du Roi Louis XIV et durant les campagnes Napoléoniennes. Le stud-book de la race fut crée en 1919, l’année de mise à jour du Syndicat du Cheval Comtois.

Le cheval de Trait Comtois se caractérise par sa nature affectueuse, calme travailleuse et généreuse. Il s’adapte aux changements climatiques.